Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F11rO88792 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F11rO88792 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
F11rO88792 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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