Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dll3O88516 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms