Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3bO88509 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms