Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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