Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccl22O88430 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms