Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lnx1O70263 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lnx1O70263 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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