Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd70O55237 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd70O55237 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms