Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RngttO55236 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RngttO55236 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RngttO55236 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RngttO55236 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RngttO55236 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RngttO55236 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RngttO55236 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RngttO55236 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RngttO55236 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms