Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms