Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aff2O55112 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aff2O55112 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aff2O55112 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms