Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrxO55103 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrxO55103 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrxO55103 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrxO55103 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrxO55103 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrxO55103 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrxO55103 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrxO55103 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrxO55103 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrxO55103 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms