Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LatO54957 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LatO54957 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LatO54957 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LatO54957 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LatO54957 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LatO54957 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LatO54957 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LatO54957 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms