Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole2O54956 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms