Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EomesO54839 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EomesO54839 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EomesO54839 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EomesO54839 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EomesO54839 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EomesO54839 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EomesO54839 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EomesO54839 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EomesO54839 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EomesO54839 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EomesO54839 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EomesO54839 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EomesO54839 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EomesO54839 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EomesO54839 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms