Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms