Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms