Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edil3O35474 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms