Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms