Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Nedd9O35177 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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