Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1aO35134 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms