Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ArxO35085 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ArxO35085 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ArxO35085 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ArxO35085 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ArxO35085 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ArxO35085 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms