Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms