Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eftud2O08810 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms