Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fpr-s1O08790 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fpr-s1O08790 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms