Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MttpO08601 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MttpO08601 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MttpO08601 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MttpO08601 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MttpO08601 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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MttpO08601 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MttpO08601 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MttpO08601 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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