Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf6O08584 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf6O08584 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf6O08584 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf6O08584 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf6O08584 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf6O08584 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf6O08584 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf6O08584 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms