Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5458L7N219 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5458L7N219 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5458L7N219 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5458L7N219 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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