Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spin2fJ3QPU0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms