Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bbip1J3QMK2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bbip1J3QMK2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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