Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930544D05RikJ3QK56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms