Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms