Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21060J3KMU4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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