Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pot1bH7BX60 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pot1bH7BX60 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms