Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4bG5E8Z2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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