Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcf11G3X9Z4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms