Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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H2-M1F7CXU4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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