Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms