Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms