Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Crocc2F6XLV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Crocc2F6XLV1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms