Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms