Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms