Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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TrdnE9Q9K5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms