Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc141E9Q8Q6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc141E9Q8Q6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms