Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dnah11E9Q7N9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Dnah11E9Q7N9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Dnah11E9Q7N9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dnah11E9Q7N9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms