Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DspE9Q557 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DspE9Q557 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DspE9Q557 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms