Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms