Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms