Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzd2E9Q1M1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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