Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad2bE9Q166 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atad2bE9Q166 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms