Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms